En l’an 2043, la terre est devenue une véritable décharge de produits toxiques nettoyée progressivement par des mutants appelés les "orbots".
Mais, après une explosion nucléaire, leur leader Raster modifie leur comportement. Ils deviennent alors une menace pour la planète. Seul Vectorman, avec ses extraordinaires capacités de métamorphoses pourra les arrêter.