Rainbow Islands est un jeu de plates-formes. Bub et Bob, les deux héros de Bubble Bobble, sont redevenus humains au terme de leur précédente aventure et ils doivent désormais sauver les îles arc-en-ciel d’une bande de monstres. Il faudra sauter et utiliser votre pouvoir pour créer des arcs-en-ciel au cours des sept mondes du jeu, divisés en quatre niveaux chacun.