Mega Man Battle Network 5 : Double Team DS regroupe les deux volets Team ProtoMan et Team Colonel déjà sortis sur GBA. Ce jeu de rôle permet de retrouver le jeune Lan et son double virtuel Mega Man alors qu’ils affrontent tous les deux le syndicat du crime Nebula dirigé par le Dr. Regal. En explorant le réseau, Mega Man doit venir à bout de virus qui menacent l’humanité.