Le joueur incarne Donkey Kong Junior, le fils du Donkey Kong capturé par Mario. Ce sera par ailleurs la première et la dernière fois que Mario jouera le rôle du méchant. Le principe du jeu est comme celui de Donkey Kong, le joueur doit atteindre Mario en haut des plateformes.Par rapport à son prédécesseur, cette suite apporte un nouvel élément de plates-formes : les lianes. Il faut également faire attention aux crocodiles se déplaçant sur celles-ci. Dans les niveaux où Donkey Kong se trouve enfermé en cage, il faudra chercher des clefs au sommet des chaînes