Le jeu est basé sur la série manga populaire Digimon, qui suit les aventures d’enfants qui peuvent accéder au monde numérique et y combattre des monstres numériques. Dans ce jeu, le méchant Milenniamon a kidnappé plusieurs enfants et prévoit de prendre le contrôle du Digiworld. Un des bons monstres, Agumon, s’est échappé et a transporté le héros Ryou dans le Digiworld. Maintenant, Ryou doit combattre les monstres, les capturer et assembler une armée pour renverser Milenniamon et sauver ses amis.

Le gameplay consiste principalement à chasser des monstres dans des donjons, puis à les envoyer combattre d’autres monstres. En ville, vous pouvez acheter des fournitures et prendre soin de vos monstres. Les combats se déroulent au tour par tour, et vous pouvez vous déplacer librement sur le champ de bataille. Dès qu’un contact avec un ennemi est engagé, une séquence de combat automatique s’ensuit.