L’histoire se déroule dans les années 1990 sur une terre ravagée par une guerre nucléaire. Dans ce désert post-apocalyptique, vous jouez un Maitre du Hokuto Shinken nommé Kenshiro, dit Ken, votre fiancée a été kidnappée par Raoh votre frère adoptif, et pour la sauver, vous devez traverser une armée infatigable d’ennemis.